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BB娱乐平台登录艾弗森Oligo赛道想超车纯化干燥工艺如何选择?

发布时间:2024-03-17 12:18:35 来源:BB贝博 作者:贝博艾弗森体育网页版访问次数:

 

  众所周知,随着寡核苷酸的应用越来越广泛,不少企业相继加入寡核苷酸合成的赛道。想得到*高纯度的核酸不是一件简单的事,寡核苷酸的合成通常会导致不可避免的杂质积累,它们可能会与全长产品竞争,或者抑制反应,因此选择高效率高质量的纯化和干燥工艺是很有必要的。那么对于工业级别的寡核苷酸纯化,一般又有哪些方法呢?且听小编跟您慢慢分享。

  探针及引物主要用于IVD试剂盒,面对需求量巨大的检测试剂盒,上游原材料的质量和供应速度应该同幅度进步和增长,在引物和探针的制备过程中,提高生产效率以及产物纯度更是重中之重。

  利用反相C-18 层析柱进行脱盐,它对 DNA 有特异性的吸附,一些杂质,如氨、盐,不能被吸附,所以能有效地去除盐分等杂质。该方法不能有效去除比目的DNA短的小片段,所以适用于要求较低的PCR普通引物。

  根据DNA 保护基( DMTr 基)和 Cartridge 柱中树脂间的亲合力作用的原理进行纯化目的 DNA 片段。该方法得到目的DNA的纯度能达到 95%以上,但受柱容量影响,适用于 40mer 以下的普通引物。

  使用变性聚丙烯酰胺凝胶电泳,对引物DNA进行分离,然后从凝胶中回收目的DNA。PAGE纯化法也是一种非常有效的DNA纯化方法,纯化后的DNA纯度大于90%,对长链 (大于50mer)普通引物的纯化特别有效。

  根据寡核苷酸的疏水性对DNA片段进行纯化分离,该方法能达到极高的纯度和灵敏度,可以有效去除N-1短片段,目标DHA的纯度大于95%。适用于对纯度要求高的短链(小于40 mer)普通引物、修饰引物,尤其适合及荧光标记探针的纯化。若想得到纯度极高的寡核苷酸片段,HPLC法也常被用于与其他方式双重联合(如HPLC_PAGE、HPLC_CE、2xHPLC等)。

  引物及Taqman探针的质量直接影响了靶标检测的准确性,所以选择干燥工艺也十分关键,在干燥过程的质量控制需尽考虑以下几个方面:

  在寡核苷酸的干燥过程中,尽量避免加热源直接照射在样品上而导致样品局部过热。红外加热模式,不直接加热样品,这样确保了样品的温度不会高于样品支架的温度,保证了样品的安全。SampleShield温度控制系统,采用非接触式温度探测用以在整个离心过程中,检测样品和离心腔的温度变化,确保整个蒸发过程受到质控。

  下图结果表明,使用EZ-2真空离心浓缩仪干燥寡核苷酸样品,可以大大降低样品降解率,保证样品不会被污染,消除了样品损坏的潜在来源。

  离心浓缩作为IVD原料合成制备的关键技术之一,具有通量高、干燥效率高、保护样品等特点,真空离心使浓缩过程都保持在较温和的环境中,提高寡核苷酸的产品纯度与收率,在工艺选择开发和放大中建立良好的工艺空间。一台高通量真空离心浓缩仪就可以做到浓缩干燥一步到位,可以直接作为生产设备投入到生产中,缩短整个Oligo制备过程,例如上述实验中所提到的

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