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BB娱乐平台登录艾弗森八爪鱼状DNA纳米结构和氧化石墨烯增强乙肝病毒DN

发布时间:2024-03-17 12:20:28 来源:BB贝博 作者:贝博艾弗森体育网页版访问次数:

 

  1)构建了一种基于八爪鱼状的DNA纳米结构(ODN)和氧化石墨烯(GO)共同增强荧光各向异性的新策略。

  (2)利用ODN的刚性结构来间隔染料和GO的距离,避免GO猝灭荧光,提高了检测的准确性。此外,由于ODN的体积大,靶物竞争的空间位阻降低,提高了反应的灵敏度。

  (3)同时ODN利用六个poly-A20牢牢吸附在GO上,提高了该方法在复杂样品检测中的抗干扰能力。

  荧光各向异性(FA)是一种基于分子旋转的生物传感方法。它是一种比率测量法,反映了荧光基团的固有特性,如尺寸、旋转速度和寿命。与其他荧光分析方法相比,荧光各向异性法对强度波动和光漂白的敏感性较低,已广泛应用于蛋白质、金属离子、小分子、核酸分子等多种靶标的检测,同时它也被用于探究物质之间的相互作用。然而,大多数方法受到目标分子质量小的限制,导致检测灵敏度有限。因此,选择合适的FA增强材料,构建具有较高灵敏度的FA检测方法是十分有意义的。

  在此工作中,作者建立了一种新型的FA放大策略。该策略以DNA四面体为骨架,将其设计为八爪鱼形状的DNA纳米结构(ODN),并结合氧化石墨烯(GO)同时增强ssDNA的荧光各向异性值(r),用于灵敏检测乙型肝炎病毒DNA(HBV-DNA)。

  如图1所示,作者用4条DNA单链S1、S2、S3和S4自组装形成ODN。同时,S1的部分序列被设计为捕获DNA (cDNA),能与探针DNA(pDNA)杂交,其余的DNA通过p-p堆积作用使ODN吸附在GO上。在没有HBV-DNA时,羧基四甲基罗丹明(TAMRA)修饰的pDNA与cDNA通过碱基互补配对杂交。同时,ODN通过6个poly-A20与GO结合,形成ODN-GO复合物。因此,TAMRA的旋转受到较大质量的GO和ODN的同时限制,得到较高的r值。加入HBV-DNA后,HBV-DNA通过立足点介导的链交换反应与pDNA杂交形成双链(dsDNA)结构,离开ODN和GO表面。此时,由于dsDNA的质量较小,在溶液中旋转速度快,TAMRA的FA值较低。因此,通过显著降低的FA值可实现HBV-DNA的灵敏检测。

  首先,用12%聚丙烯酰胺凝胶电泳(PAGE)证实了ODN的形成。此外,利用原子力显微镜对GO和ODN-GO进行了表征,证实了ODN-GO的成功构建。

  接着作者验证了该方法的可行性,证实了只能当GO和ODN同时存在时,Δr/r0最大。ODN-GO增强的Δr/r0值比单独使用ssDNA约高2.5倍,比单独使用GO约高2倍。作者也证实ODN具有较强的刚性结构和较高的增强FA的能力。

  最后,在最佳的实验条件下,Δr/r0与HBV-DNA在1 nM-50 nM浓度范围内呈良好的线),其中c为HBV-DNA浓度(单位为nmol/L)。检测限(LOD)为330 pM (3σ/k)。相较于只有GO增强和只有ODN增强的FA策略,作者提出的方法具有更高的灵敏度。

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